1.醫務管理學系的成立
民國八十四年三月全民健康保險正式開辦以來，醫療環境急需整合重組，各醫療機構對於醫務管理行政人才頓時需求倍增，而本校鑑於保險體制的變革發展，為培養醫務管理專業人才，因此醫務管理學系便於民國八十六學年成立招生，現每年招收學生六十名。
2.醫學研究所醫務管理組的成立
為了培養醫療機構之中高級幹部與領導人才，同時增進我國醫療機構之經營與學術研究水準，於民國八十七年起在醫學研究所下增設「醫務管理組」，開始招收醫管碩士研究生，同時籌劃申請成立醫務管理學研究所。
3.醫務管理學系碩士班的成立
醫務管理學系碩士班於民國八十九年獲准成立招生，現每年招收碩士班一般生九名。
4.醫務管理學系碩士在職專班的成立
為提供現行體系下，醫務管理相關人員在職進修研究所碩士班的管道，以落實高等教育及終身學習之理念，並培養社會亟需管理與實務兼備之醫療機構中、高級領導人才，醫務管理學系碩士在職專班於民國九十年獲准成立招生，現每年招收碩士在職專班研究生十名。
